الصحة

العينات السريرية للاختبار التشخيصي nCoV لعام 2019

العينات السريرية للاختبار التشخيصي nCoV لعام 2019

 الحصول على العينات السريرية للاختبار التشخيصي nCoV لعام 2019 وفقًا لإرشادات مركز السيطرة على الأمراض. تم جمع 12 عينة من مسحة البلعوم الأنفي والبلعوم مع مسحات من الألياف الاصطناعية. تم إدخال كل مسحة في أنبوب معقم منفصل يحتوي على 2 إلى 3 مل من وسط النقل الفيروسي. تم جمع المصل في أنبوب فاصل المصل ثم طرده بالطرد المركزي وفقًا لإرشادات مركز السيطرة على الأمراض.

تم جمع كل من عينات البول والبراز في حاويات عينات معقمة. تم تخزين العينات بين 2 درجة مئوية و 8 درجات مئوية حتى جاهزة للشحن إلى مركز السيطرة على الأمراض. تم جمع عينات لتكرار اختبار 2019-nCoV في أيام المرض 7 و 11 و 12 وشملت مسحات البلعوم الأنفي والبلعوم والمصل وعينات البول والبراز.

  • الاختبار التشخيصي لـ 2019-NCOV

تم اختبار العينات السريرية باستخدام مقايسة rRT-PCR التي تم تطويرها من تسلسل الفيروس الذي تم إصداره علنًا. على غرار الاختبارات التشخيصية السابقة للفيروس التاجي الحاد المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة (SARS-CoV) والفيروس التاجي لمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية (MERS-CoV) ، فإنه يحتوي على ثلاثة أهداف جينية للنواة وهدف تحكم إيجابي. يتوفر وصف لهذا الفحص 13 ومعلومات التسلسل لطبقات لوحة rRT -PCR والمسبارات 14 على موقع CDC Laboratory Information الخاص بـ 2019-nCoV. 15

  • التسلسل الجيني

في 7 يناير 2020 ، شارك الباحثون الصينيون التسلسل الجيني الكامل لـ 2019-nCoV من خلال قاعدة بيانات المعاهد الوطنية للصحة GenBank 16 والمعهد العالمي لمشاركة جميع بيانات الإنفلونزا (GISAID) 17 ؛ تم نشر تقرير حول عزل 2019-nCoV في وقت لاحق. 18تم استخلاص الحمض النووي من عينات موجبة لـ rRT-PCR (الفم البلعومي والبلعوم الأنفي)

  • تسلسل الجينوم الكامل

استُخدم لتسلسل الجينوم الكامل على منصات التسلسل Sanger والجيل التالي (Illumina و MinIon). تم الانتهاء من تجميع التسلسل باستخدام برنامج Sequencher ، الإصدار 5.4.6 (Sanger) ؛ برنامج minimap ، الإصدار 2.17 (MinIon) ؛ وبرامج Freebayes ، الإصدار 1.3.1 (MiSeq). تمت مقارنة الجينومات الكاملة مع التسلسل المرجعي المتاح لعام 2019-nCoV (رقم انضمام GenBank NC_045512.2)

السابق
التصوير الشعاعي للصدر مع تغير في حالة الجهاز
التالي
طريقة تحضير 15 طريقة بارعة لخدمة المعكرونة ورامين

اترك تعليقاً

هذا الموقع يستخدم Akismet للحدّ من التعليقات المزعجة والغير مرغوبة. تعرّف على كيفية معالجة بيانات تعليقك.